В марте 1944 года, после прорыва советскими войсками блокады Ленинграда, 5-ю партизанскую бригаду расформировали. Уже в марте 1944 года был призван в Советскую Армию Ленинским РВК г. Ленинграда. С мая 1944 года по июнь 1944 года Сергеев Алексей Николаевич - сержант, командир отделения 314-й стрелковой дивизии 1076 стрелкового полка. На Ленинградском фронте при наступлении на г. Выборг было тяжело шли бои в каменистых и лесных условиях, а также в самом городе при уничтожении фашистов в домах. За освобождение г. Выборга 1076-му стрелковому полку было присвоено звание Выборгский. Получив ранение, командир роты был заменен командиром взвода, а Алексею Сергееву было приказано принять командование взводом, как первому командиру отделения. Все задачи, поставленные перед взводом, были выполнены. 28 июня 1944 года в боях за освобождение г. Выборг Алексей был ранен. С 28 июня по сентябрь 1944 года по ранению он находился в 264-м госпитале в г. Ленинград. Там застала его весть о гибели брата Павла.
После выздоровления был направлен в 497-й стрелковый полк 135-ю стрелковую дивизию в звании сержанта, командира отделения. Это был 1-й Украинский фронт. Там Алексей Николаевич принимал участие в Висло-Одерской операции. Вели бои за освобождение Котовце, Масловица в Польше, освобождение других городов в Польше и Германии. Особенно тяжелыми были бои за Одер. После этого боя был направлен на курсы младших офицеров 1-го Украинского фронта.
Победу встретил, не дойдя до Берлина 40 км на фронтовых курсах младших офицеров 1-го Украинского фронта. Долго жалел об этом, всего 40 км до Берлина не дошел!
Затем – учеба во Втором Ташкентском пулеметном училище (август-декабрь 1945 г., г. Термез Туркестанский ВО), Ашхабадском пехотном училище (декабрь 1945 г. – июль 1946 г., г. Ташкент Туркестанский ВО), и снова – в Ташкентском пехотном училище им. В. И. Ленина (август 1946 г. – сентябрь 1948 г., г. Ташкент Туркестанский ВО). Рвался в Германию, хотелось увидеть Рейхстаг. Но не довелось. В это время на должность командующего Туркестанским военным округом был назначен бывший командующий 1-го Украинского фронта генерал армии Иван Петров. Хорошо зная, что среди выпускников училища немало тех, с кем он бил фашистов в военные годы, сумел Иван Ефимович убедить зеленых взводных: «Вы уйдете, я тут с кем останусь?». Эти слова подействовали сильнее приказа. Так Алексей Сергеев остался на службе на Кушке. Потом среди военных появилась пословица: меньше взвода не дадут, дальше Кушки не пошлют.